中國太平洋學會秘書處是學會日常辦事機構。秘書處由秘書長、常務副秘書長、副秘書長及相關工作人員組成。在會長領導下，秘書長按學會章程的規(guī)定負責主持秘書處開展日常工作。秘書處具體職責包括：

一、 貫徹執(zhí)行理事會、常務理事會、會長辦公會議的各項決議，完成會長和理事會布置的工作任務；

二、 負責文件資料收發(fā)，起草學會的有關文件、工作計劃、總結、規(guī)章制度以及有關建議和報告；

三、 負責管理學會印鑒和檔案工作；

四、 協(xié)助學會財務部門管理學會的財務、資產(chǎn)和會費收繳工作；

五、 負責各種會議和活動的籌備、組織工作；

六、 管理學會專兼職人事、內(nèi)設機構和分支機構；

七、 負責學會內(nèi)外接待、聯(lián)系和協(xié)調工作；

八、 負責組織開展學會各項業(yè)務職能工作；

九、 負責組織學會學術研究項目的立項、申報、實施和結題；

十、 負責學會內(nèi)部有關證書的制作發(fā)放；

十一、 負責學會的會員發(fā)展和組織建設；

十二、 負責科普和宣傳報道；

十三、 做好學會負責人交辦的其他工作。